部分患者病程短，恢复快，且不留后遗症，预后良好。
部分患者病情迅速加重，出现病毒性肺炎、成人呼吸窘迫综合征、呼吸衰竭、心衰及肾衰等多器官衰竭、败血症休克及Reye综合征等多种并发症而死亡。
从1997年香港禽流感统计资料可以看出，18例确诊禽流感患者死亡6例，死亡率为33.3％。
越南10例确诊患者中，有8例死亡。 可见禽流感患者的死亡率是比较高的。